Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHORDC1Q9UHD1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHORDC1Q9UHD1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms