Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5BQ9UGL1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5BQ9UGL1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms