Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EPHA6Q9UF33 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms