Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
APEX2Q9UBZ4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms