Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DBF4Q9UBU7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DBF4Q9UBU7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms