Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGC1AQ9UBK2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms