Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHRF1Q9P1Y6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms