Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PDP1Q9P0J1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDP1Q9P0J1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms