Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GINM1Q9NU53 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms