Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI1

BRD7, Bromodomain-containing protein 7, humanhuman

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Length 651 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD7Q9NPI1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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BRD7Q9NPI1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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BRD7Q9NPI1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BRD7Q9NPI1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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