Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ELL3Q9HB65 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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