Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SMURF2Q9HAU4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMURF2Q9HAU4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms