Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCDC90BQ9GZT6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCDC90BQ9GZT6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms