Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
POLR2J2Q9GZM3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms