Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
BHLHE41Q9C0J9 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms