Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF559Q9BR84 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF559Q9BR84 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms