Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIK3R4Q99570 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms