Protein–RNA interactions for Protein: Q96CJ1

EAF2, ELL-associated factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF2Q96CJ1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EAF2Q96CJ1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EAF2Q96CJ1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms