Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SNX29Q8TEQ0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms