Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC63Q8NA47 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC63Q8NA47 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms