Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CHCHD4Q8N4Q1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms