Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BHLHA9Q7RTU4 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BHLHA9Q7RTU4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms