Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RTL6Q6ICC9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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