Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLX4IPQ5VYV7 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLX4IPQ5VYV7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms