Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
AGAP9Q5VTM2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms