Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDCA8Q53HL2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDCA8Q53HL2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms