Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCGF3Q3KNV8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms