Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KLHL38Q2WGJ6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms