Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ODF4Q2M2E3 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF4Q2M2E3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF4Q2M2E3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF4Q2M2E3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF4Q2M2E3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF4Q2M2E3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF4Q2M2E3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ODF4Q2M2E3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF4Q2M2E3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF4Q2M2E3 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF4Q2M2E3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF4Q2M2E3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF4Q2M2E3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF4Q2M2E3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF4Q2M2E3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ODF4Q2M2E3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms