Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CDO1Q16878 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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