Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PRKD1Q15139 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
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