Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HERC3Q15034 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERC3Q15034 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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