Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SEMA3AQ14563 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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