Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SCARF1Q14162 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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