Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
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SHROOM2Q13796 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHROOM2Q13796 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
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SHROOM2Q13796 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
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SHROOM2Q13796 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHROOM2Q13796 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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