Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN13Q12923 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms