Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
COX10Q12887 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX10Q12887 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX10Q12887 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX10Q12887 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX10Q12887 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
COX10Q12887 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
COX10Q12887 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
COX10Q12887 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms