Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FAM27E3Q08E93 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM27E3Q08E93 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms