Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPOCK1Q08629 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms