Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
DHX9Q08211 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DHX9Q08211 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms