Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TGM3Q08188 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
TGM3Q08188 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms