Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK18Q07002 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms