Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
GABPAQ06546 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABPAQ06546 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms