Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1BQ00975 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms