Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FGD1P98174 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FGD1P98174 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FGD1P98174 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms