Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H3F3AP84243 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H3F3AP84243 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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