Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PCBP4P57723 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PCBP4P57723 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms