Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BACE1P56817 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BACE1P56817 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BACE1P56817 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BACE1P56817 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
BACE1P56817 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BACE1P56817 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
BACE1P56817 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BACE1P56817 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BACE1P56817 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
BACE1P56817 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BACE1P56817 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BACE1P56817 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BACE1P56817 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BACE1P56817 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BACE1P56817 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BACE1P56817 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms