Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP153P49790 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP153P49790 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP153P49790 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP153P49790 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP153P49790 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP153P49790 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NUP153P49790 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP153P49790 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP153P49790 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP153P49790 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP153P49790 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP153P49790 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP153P49790 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP153P49790 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP153P49790 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP153P49790 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NUP153P49790 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP153P49790 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP153P49790 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP153P49790 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP153P49790 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP153P49790 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP153P49790 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP153P49790 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP153P49790 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP153P49790 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NUP153P49790 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NUP153P49790 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NUP153P49790 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP153P49790 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP153P49790 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP153P49790 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP153P49790 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP153P49790 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP153P49790 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NUP153P49790 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms