Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ME1P48163 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ME1P48163 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ME1P48163 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ME1P48163 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms